Koło Naukowe Genetyki i Epigenetyki

Natalia Pa�czy�ska
"Intron i5 w genie tubA Euglena gracilis - intron konwencjonalny, niekonwencjonalny czy po�redni?"

Introny, czyli niekoduj�ce odcinki gen�w, s� usuwane z pre-RNA, zanim uzyska on pe�n� funkcjonalno��. Ze wzgl�du na mechanizm wycinania, wyr�niamy trzy typy intron�w: samowycinaj�ce si� (grupy I, II i III), spliceosomalne oraz introny tRNA. W genach j�drowych euglenin wyst�puj� ponadto introny niekonwencjonalne, o nieznanym mechanizmie usuwania, posiadaj�ce niekonserwowane sekwencje z��czy i tworz�ce stabiln� struktur� drugorz�dow�. Niekt�rzy badacze wyr�niaj� dodatkowo introny po�rednie � charakteryzuj� si� one obecno�ci� struktury drugorz�dowej i konserwowan� sekwencj� z��czy (jednego lub obydwu).

W genie tubA u Euglena gracilis (szczep Z) stwierdzono wyst�powanie intronu i5, kt�ry zakwalifikowano jako intron po�redni. Ze wzgl�du na obecno�� powt�rze� nukleotydowych istniej� cztery dopuszczalne pozycje jego wyst�powania, lecz tylko w jednej z nich zachowane s� sekwencje z��czy charakterystyczne dla intron�w spliceosomalnych (GC-AG). Por�wnanie struktury drugorz�dowej intronu i5 z modelem konsensusowym opracowanym dla intron�w niekonwencjonalnych wskazuje, �e intron ten mo�e by� jednak wycinany w pozycji, gdzie sekwencje z��czy nie s� zgodne z regu�� GT/C-AG. Ustalenie sekwencji intronu i5 w genie tubA z innych szczep�w E. gracilis pozwoli wskaza�, kt�ry z dw�ch element�w �cis�: struktura drugorz�dowa czy te� sekwencje z��czy GC-AG s� konserwowane pomi�dzy blisko spokrewnionymi ze sob� taksonami. Dzi�ki temu mo�liwe b�dzie wskazanie mechanizmu odpowiedzialnego za wyci�cie intronu i5. Badania dostarcz� tak�e nowych informacji na temat mo�liwo�ci zmiany mechanizmu wycinania intron�w j�drowych u euglenin w przypadku obecno�ci sygna��w charakterystycznych dla intron�w dw�ch typ�w.

18.04.2013

Powr�t


Aktualno¶ci Archiwum Seminaria Badania Działalno¶ć	Natalia Pa�czy�ska *"Intron i5 w genie tubA Euglena gracilis* - intron konwencjonalny, niekonwencjonalny czy po�redni?"** Introny, czyli niekoduj�ce odcinki gen�w, s� usuwane z pre-RNA, zanim uzyska on pe�n� funkcjonalno��. Ze wzgl�du na mechanizm wycinania, wyr�niamy trzy typy intron�w: samowycinaj�ce si� (grupy I, II i III), spliceosomalne oraz introny tRNA. W genach j�drowych euglenin wyst�puj� ponadto introny niekonwencjonalne, o nieznanym mechanizmie usuwania, posiadaj�ce niekonserwowane sekwencje z��czy i tworz�ce stabiln� struktur� drugorz�dow�. Niekt�rzy badacze wyr�niaj� dodatkowo introny po�rednie � charakteryzuj� si� one obecno�ci� struktury drugorz�dowej i konserwowan� sekwencj� z��czy (jednego lub obydwu). W genie tubA u Euglena gracilis (szczep Z) stwierdzono wyst�powanie intronu i5, kt�ry zakwalifikowano jako intron po�redni. Ze wzgl�du na obecno�� powt�rze� nukleotydowych istniej� cztery dopuszczalne pozycje jego wyst�powania, lecz tylko w jednej z nich zachowane s� sekwencje z��czy charakterystyczne dla intron�w spliceosomalnych (GC-AG). Por�wnanie struktury drugorz�dowej intronu i5 z modelem konsensusowym opracowanym dla intron�w niekonwencjonalnych wskazuje, �e intron ten mo�e by� jednak wycinany w pozycji, gdzie sekwencje z��czy nie s� zgodne z regu�� GT/C-AG. Ustalenie sekwencji intronu i5 w genie tubA z innych szczep�w E. gracilis pozwoli wskaza�, kt�ry z dw�ch element�w �cis�: struktura drugorz�dowa czy te� sekwencje z��czy GC-AG s� konserwowane pomi�dzy blisko spokrewnionymi ze sob� taksonami. Dzi�ki temu mo�liwe b�dzie wskazanie mechanizmu odpowiedzialnego za wyci�cie intronu i5. Badania dostarcz� tak�e nowych informacji na temat mo�liwo�ci zmiany mechanizmu wycinania intron�w j�drowych u euglenin w przypadku obecno�ci sygna��w charakterystycznych dla intron�w dw�ch typ�w. 18.04.2013 Powr�t	O kole Linki Kontakt Galeria Forum
	Koło Naukowe Genetyki i Epigenetyki Wydział Biologii Uniwersytet Warszawski